Prévalence et caractérisation moléculaire d’Echinococcus granulosus sensu lato chez le dromadaire dans le grand sud d’Algérie

Abstract

L'échinococcose kystique est une maladie parasitaire causée par un métacestode appartenant au complexe Echinococcus granulosus sensu lato (s.l.). Cette maladie revêt une importance économique et de santé publique considérable. L'échinococcose kystique est endémique aussi bien chez les bétails que chez l'homme dans les pays d'Afrique du Nord, dont l'Algérie. En Algérie, la plupart des études ont été concentrées sur l'estimation des taux de prévalence au niveau des abattoirs, particulièrement chez les ruminants, tandis que, peu d'études ont été rapportées sur le génotypage et la diversité génétique de ce complexe E. granulosus s.l. La présente étude a été menée pour estimer la prevalence et la caractérisation moléculaire d’E. granulosus s.l. chez le dromadaire (Camelus dromedarius) de l'extrême Sahara Algérien, en utilisant deux marqueurs génétiques mitochondriaux récemment développés (gène codant pour NADH déshydrogénase sous-unité 2 et NADH déshydrogénase sous-unité 5), pour une identification fiable des différents génotypes. De Janvier 2017 à Décembre 2020, 16536 carcasses de dromadaires ont été examinées dans deux abattoirs du Sahara (Tindouf et Illizi) pour la recherche des kystiques hydatiques. Au total, 75 kystes hydatiques ont été collectés de 49 dromadaires, dont 65 et 10 kystes de 45 et 4 dromadaires provenant respectivement des deux abattoirs de Tindouf et Illizi. Globalement, un taux d’infestation de 0,29 % (49/16536) a été enregistré. L'examen microscopique de tous les kystes hydatiques collectés a montré un taux de fertilité de 5,33 % (4/75). Tous les kystes fertiles ont été observés au niveau du foie. Le taux d'infestation selon le sexe était de 0,25 % et 0,89 % chez les mâles et les femelles, respectivement. La localisation la plus fréquente des kystiques hydatiques chez les dromadaires infestés a été observée au niveau du foie (43/49 ; 87,76 %), suivie par les poumons (4/49 ; 8,16 %), et enfin deux dromadaires ont montré une infestation mixte (2/49 ; 4,08 %). Le génotypage des kystes hydatiques collectés a montré la présence d’E. granulosus sensu stricto (s.s.) (G1, G3) et E. granulosus s.l. G6 sur la base des séquences du gène nad5 (649 pb) et les séquences concaténées des deux gènes nad5 et nad2 (total de 1336 pb), respectivement. 11 haplotypes différents (ALG1-ALG11), dont quatre haplotypes (ALG8-ALG11) pour E. granulosus s.s. G1, un haplotype (ALG7) pour E. granulosus s.s. G3 et six haplotypes (ALG1-ALG6) pour E. granulosus s.l. G6 ont été déterminés par l’analyse du réseau phylogénétique. La présente étude rapporte des données épidémiologiques très importantes sur l'échinococcose kystique chez le dromadaire de deux régions de l'extrême Sahara Algérien en ce qui concerne la prévalence, le génotypage et la diversité génétique au sein d’E. granulosus s.l. Par conséquent, le dromadaire pourrait jouer un rôle essential dans le maintien du cycle épidémiologique d'E. granulosus s.l. dans le désert. La caractérisation moléculaire des échantillons G1, G3 et G6 sur la base du séquençage de génome mitochondrial complet serait d'une importance considérable pour une compréhension plus complète de l'épidémiologie moléculaire de l’échinococcose kystique chez le dromadaire en Algérie.