Caractérisation moléculaire de cryptospridium SPP. et microsporidia chez les équidés en Algérie

Abstract

Suite à une étude épidémiologique portant sur la cryptosporidiose équine, 481 échantillons de matières fécales (357 chevaux et 124 ânes) ont été récoltés au niveau de la jumentrie de Tiaret, certains centres hippiques situés dans la Wilaya d'Alger et plusieurs régions rurales localisées dans la Wilaya de Sétif et Bordj Bou Arreridj. La mise en évidence des cryptosporidies a été réalisée par l'utilisation combinée des méthodes usuelles de coloration (Ritchie simplifiée par Allen et Redly associée à la coloration de Ziehl Neelsen modifiée) et des techniques de la biologie moléculaire (nested PCR et séquençage). Chez la population équine, l'étude a montré une prévalence de 6,02 % par l'examen microscopique et 2,70 % par la réaction PCR. Chez les chevaux, Cryptosporidium spp a été isolé avec un taux d'infestation de 7,28 % par coloration et 2,52 % par nested PCR. Respectivement, les deux techniques ont révélé une prévalence de 2,41 % et 3,22 % chez les ânes. Les poulains âgés moins de deux ans ont été infectés avec un taux de 9,6% par microscopie et 2,4 % par l'amplification PCR. Les chevaux adultes ont présenté une prévalence de 6,03% et 2,58% par les deux techniques utilisées. Un jeune âne âgé moins de deux ans a été détecté positif par nested PCR et les ânes adultes ont montré un taux d'infestation de 2,63% par les deux méthodes de diagnostic. Dans les élevages collectifs prélevés au niveau de la Wilaya de Tiaret et d'Alger, tous les chevaux positifs au Cryptosporidium spp ont été isolés dans la jumentrie de Tiaret. L'infestation des chevaux et les ânes n'a été pas associée avec des diarrhées. Quatre espèces, C. parvum, C. muris, C. hominis et C. erinacei ont été identifiées chez les chevaux et chez les ânes pour les deux premières espèces par l'amplification et le séquençage du gène SSU rDNA. L'étude des variations génétiques au sein de ces espèces de Cryptosporidium par l'amplification et le séquençage du gène Gp60 a montré la présence du subtype IIaA16G1R1 de C. parvum, un nouveau subtype (IkA15G1) de C. hominis et XIIIa A22R9 de C. erinacei (préalablement connu comme hedgehog genotype). Cette étude rapporte pour la première fois, la prévalence de Cryptosporidium spp chez les chevaux et les ânes en Algérie et la première occurrence de C. erinacei, C. hominis et C. muris chez les équidés.